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Master 2 Pro Bioinformatique et Génomique

Responsables

  • Pr. Pedro COUTINHO
  • Pr. Pascal RIHET

 

Objectifs de la formation

L’objectif général est de former des bioinformaticiens et des spécialistes dans l’analyse du génome et de l’expression des gènes, maîtrisant à la fois les concepts et les méthodes. Les étudiants pourront choisir un parcours à dominante bioinformatique ou un parcours à dominante génomique.

Les étudiants reçoivent un enseignement ciblé sur:

  • la génomique fonctionnelle
  • les technologies pour l’analyse du génome (variabilité des génomes humains, animaux, végétaux et microbiens et manipulations des génomes), du transcriptome et du protéome (analyse massive des variations du transcriptome et du protéome)
  • la phylogénie.

Cet ensemble constitue la partie spécifique du programme pédagogique du master professionnel en génomique et en bioinformatique.

Un enseignement non scientifique partagé avec d’autres masters (droit, management, qualité, communication, anglais) est également dispensé. Au delà des connaissances théoriques nécessaires, il s’agit aussi d’acquérir un savoir-faire. Ainsi, les étudiants reçoivent un enseignement pratique ciblé sur les méthodes et outils avancés de la génomique et/ou de la bioinformatique : techniques d’analyse des variations génétiques et du transcriptome, programmation objet, analyse des réseaux biologiques….

L’accès aux plateformes de Marseille-Nice genopole/IBiSA facilite la mise en place de ces formation pratiques.

Semestre S3-P

 

Tronc commun S3-P

10.1   Génomique Fonctionnelle (6 ECTS)

10.2   Droit, management, protection industrielle et qualité (3 ECTS)

10.3   Anglais : préparation au TOIEC (3 ECTS)

18 ECTS à choisir parmi

9.02   Polymorphisme, phylogénie, évolution et génomique environnementale (6 ECTS)

9.03   Programmation Orientée Objet (6 ECTS)

9.04   Graphes et réseaux d’interactions biologiques (3 ECTS)

9.05   Génomique des Organismes Modèles (3 ECTS)

9.06   Méthodes bioinformatiques pour la Cis-régulation (3 ECTS)

9.07   Biostatistiques avancées (3 ECTS)

9.08   Atelier polymorphisme (3 ECTS)

9.09   Analyses bioinformatiques et statistiques des polymorphismes (3 ECTS)

9.10   Atelier transcriptome (3 ECTS)

9.11   Atelier de génomique (3 ECTS)

9.12   Analyse statistique de données génomiques (3 ECTS)

9.13   Analyse bioinformatique des données à haut débit (3 ECTS)

9.14   Algorithmique pour la bioinformatique

7.1      PBA (6 ECTS)

9.15   Modules d’ouverture pouvant être choisis dans l’option BiSe ou dans d’autres mentions de master (2x3 ECTS)

Semestre S4-P

 10.2 Stage en entreprise ou sur plate-forme technologique (mars-septembre)