Master 2 Recherche

Master 2 Recherche

Stages proposés dans le cadre du master 2 recherche 2017-2018

Nous vous rappelons que l'accord formel d'un Maitre de stage est indispensable à votre candidature.

Les intitulés en vert sont déjà pourvus

0- FORMULAIRE DE PROPOSITION DE STAGE

1-Interactome de syndromes progeroïdes

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2-Exploring an uncharted genome by comparative genomics: characterizing distant orthologues in the genome of a pathogenic fungus

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3-Neutralisation du virus Ebola par des "nanobodies" (anticoprs de camélidés)

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4-Etudes structurales de la Sortase PorU du T9SS de P. gingivalis

5-Implication of alternative promoter usage in normal and leukemic T-cell

6-Exploration fonctionnelle du site d'oxydation des quinols dans les complexes respiratoires de la bactérie Escherichia coli

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7-Variabilité génétique et réseaux d'interactions

8-Rôle d'une thiorédoxine atypique (Patrx2) dans la machine de sécrétion de type 6 chez Pseudomonas aeruginosa

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9-Dynamique des protéines: approches innovantes par incorporation d'acides aminés non naturels, marquage de spin et spectrométrie RPE

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10-Prédisposition génétique au sepsis chez l'homme: de la recherche in silico de mutations situées dans des régions cis-régulatrices à la validation expérimentale des mutations candidates

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11-Modélisation dynamique de réseaux moléculaires perturbés par des variants génétiques associés au septis ou au paludisme

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12- Etude structurale et fonctionnelle de la dynamique de polymerisation des nucleoproteines d'Arenavirus sur un ARN

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13- Defense antibactérienne de l'hôte: caractérisation structurale et fonctionnelle de l'interaction BPI/Gal-1

14- Etude stucture/fonction d'une déshydrogénase fongique d'intérêt en biotechnologie

Giuliano SCIARA

15- Etude des relations structure-fonction des méga-enzymes Ployketide Synthases

17-Bases structurales pour le clivage du peptidoglycane par les N-acetylglucosaminidases

Florence VINCENT

18-Controle génétique du veillissement cardiaque chez la drosophile: étude d'association à l'échelle du génome.

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19-Molecular modelling of protein/surfactant interactions for the understandingof membrane protein stabilization and crystallisation

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20-Validation fonctionnelle de mutations au locus HSPG2, un nouveau gene candidat de la bicuspidie aortique chez l'Homme

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Stages proposés précedemment (2016-2017)

1- Approches de biologie des systèmes pour l'étude des maladies

2-Biomimétisme des interactions entre la membrane endosomale et le cytosquelette d'actine (stage pourvu)

Emmanuelle HELFER

3-Interactions protéines-lipides et assemblage des protéines membranaires.

4-Mesures dynamiques des molécules d'adhérence jonctionnelle par vidéonanoscopie.

5-Analyse comparative du transcriptome de différents couples virus géant/hôte amibien

Matthieu LEGENDRE

6-Caractérisation des protéines Fe-S des virus géants à la recherche de nouvelles voies métaboliques (déjà attribué)

Audrey LARTIGUE

7-Caractérisation structurale et fonctionnelle d'un complexe de réplication virale (déjà attribué)

8-Bases moléculaires des propriétés catalytiques du cofacteur à molybdènede la TMAO réductase.

Barbara SCHOEPP

9-Exploration fonctionnelle du site d'oxydation des quinols de la nitrate réductase d'E.Coli

Eric PILET , Stéphane GRIMALDI

10- Etude structure/fonction de nouvelles glycosyltransférases impliquées dans la glycosylation du flagelle bactérien (déjà attribué)

Gerlind SULZENBACHER

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11- Exploring an uncharged genome; characterising distant orthologues in the genome of drechmeria coniospora

Bianca HABERMANN; Jonathan EWBANK

12- Modélisation dynamique de l’activation de lymphocytes T. Prédiction de
l’effet de variants génétiques associés à la susceptibilité au sepsis sur la réponse aux
agents pathogènes.

Claudine CHAOUIYA, Pascal RIHET

13- Analyses bioinformatiques de données de séquençage pour l'étude de la réplication des enhancers et des promoteurs au cours du cycle cellulaire (déjà attribué)

Benoit BALLESTER

14-SNP et épissage (déjà attribué)

Vincent LACROIX

15-Rôle de la protéine XcpY dans l'assemblage et le fonctionnement du secreton Xcp

16- Etudes biochimiques et structurales en vue de l'analyse de la sélectivité d'inhibiteurs de bromodomaines (déjà attribué)

Stéphane BETZI

17-Méthodes bioinformatiques pour la discrimination de contaminants dans les
séquences NGS (déjà attribué)

Jacques vanHelden

18-Relations structure-‐réactivité du centre cuivre-‐“histidine brace” des LPMOs (Lytic
Polysaccharide MonoOxygenases), des enzymes-‐clé de la dégradation des polysaccharides récalcitrants (stage déjà pourvu)

Christophe DECROOS

19-Benchmarking dimensionality reduction techniques for cancer pharmacogenomics data

Pedro BALLESTER

20-Analyse structurale, fonctionnelle et comparative des génomes de bactéries océaniques du genre Shewanella

Emmanuel TALLA, Michel FONS

21-Rôle de l'inflammation dans les cardiomyopathies (déjà attribué)

Nathalie LALEVEE

22-Composition, structures et activités des procaryotes dans la zone non éclairée des
océans

Christian Tamburini

23-Contrôle génétique de la fonction et du vieillissement cardiaque chez la
Drosophile : une approche post-GWAS

24-Relations structure-fonction de senseurs hybrides contrôlant le mode de vie bactérien

Florence VINCENT, Yves BOURNE

25- Assamblage et annotation du génome de Drosophila suzukii (stage déjà pourvu)

26-Développement d'outils pour étudier l'internalisation d'exosomes par des approches de microscopie et de chemioluminescence

27- Unravelling the structural and functional basis of calmodulin-regulated protein kinases regulation

Anne-Sophie HUART

28- Effect of integrin activation on the mechanical response of living cells using atomic force microscopy

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stages 2015-2016:

1-Mesures dynamiques des molécules d'adhérence jonctionnelles par vidéonanoscopie.

2-Analysis of non-coding genetic varaints involved in adult heart performance in a natural population of drosophilia flies

3-Prédisposition génétique au sepsis chez l'homme: à la recherche in silico de mutations fonctionnelles modifiant la séquence de la protéine ou le niveau d'expression du gène

4-Prédisposition génétique au sepsis chez l'homme: de la recherche in silico de mutations situées dans des régions cis-régulatrices à la validation expérimentale des mutations candidates

5- Structure-based drug design of coumpounds modulating PDZ domains-containing proteins

6 - Bases moléculaires de la formation et la conformation de partenariats entre des molécules d’adhérence des synapses neuronales

Adeline Goulet / Pascale Marchot

7 - The application of machine learning to predict drug response in NCI-60 cell lines

Pedro Ballester

8-Analyses bioinformatiques de données NGS pour l'étude des régions non-codantes et régulatrices du génome humain.

Benoit Ballester

9-Spectroscopic characterization of arnenite oxidase Aio mitants

Barbara Schoepp-Cothenet

10- Interaction de la protéine tau avec les microtubules reconstitués in vitro et imagée par microscopie de fluorescence de la molécule unique.

Gilles Breuzard et vincent Peyrot

11 - Caractérisation des régions désordonnées et « coiled-coil » de la protéine VP35 du virus Ebola.

12- Etude multidisciplinaire pour une meilleure compréhension du fonctionnement d’une protéine à cuivre au sein d’un supercomplexe protéique.

Marlène Martinho

13-Etude des séquences enhancer dérégulées dans les leucémies

Salvatore Spicuglia

14-Etude structurale et fonctionnelle de la signalisation sur un système à deux composants hybridse de bacteroides WH2, un agent majeur du microbiome intestinal humain.

Florence Vincent

15-Protéines moonlighting et petits motifs linéaires

Christine Brun

16-Approches de biologie des systèmes pour l'étude des maladies

17-High-speed atomic force microscopy (HS-AFM): Imaging of protein-protein and protein-membrane interactions at high spatio-temporal resolution.

Simon Scheuring

18-Rôle du noyau de l'hôte au cours du cycle infectieux des virus géants

Dorothée Murat

19-Carcatérisation fonctionnelle des éléments transposables chez les procaryotes

Sébastien Tempel, Emmanuel Talla

20- Mécanisme de contrôle de l'assemblage du récepteur pré-B: Caractérisation structurale du premier point de contrôle du développement des lymphocytes B.

21-Contôle génétique du vieillissement cardiaque chez la drosophile: une approche de biologie des systèmes

Laurence Röder

22- Developement d'un outil biofinformatique d'analyse et de gestion de donneés pour lamicrocaolrimetrie et l'imagerie cellulaire : applications aux interactions microtuble - MAP

Devred François

23-Rôle de l'inflammation dans les cardiomyopathies (Stage déjà pourvu)

Nathalie LALEVEE

24- Relation structure-fonction de senseurs hybrides contrôlant le mode de vie bactérien

Florence Vincent

25- Assemblage et annotation du génome de drosophila suzukii (stage déjà pourvu)