Bioinformatique pour la génomique et la protéomique: applications (3 crédits) [Coutinho P.]

Code: SBBAU4L

Objectif(s): Comprendre l’utilité, les bases algorithmiques et les outils les plus utilisés pour diverses méthodes bioinformatiques: alignement, phylogénie moléculaire, prédiction et modélisation d’aspects structuraux des protéines, cis-régulation - 2 TD sur ordinateur pour consolider des notions théoriques

Volume horaire: 14h de CM - 8h de TD - 0 de TP

Description

Cette unité vise à comprendre l’intérêt et les principes de plusieurs méthodes bioinformatiques reposant sur l’analyse de séquences biologiques: alignements multiples de séquences - prédiction de la structure secondaire - prédiction et modélisation de la structure des protéines - bases de la phylogénie moléculaire - cis-régulation. L'accent de cette demi-unité et faire le lien entre l’utilité, la mise en place et fiabilité de diverses méthodes et applications bioinformatiques d’intérêt général. Les étudiants sortiront avec des bases qui lui permettront de mieux comprendre l’utilité d’autres approches bioinformatiques. Elle s'organise autour de cours théoriques complétés par 2 TD (2x4 heures) de consolidation des notions vues en cours. Les séances de TD visent à illustrer les notions en cours.

Prérequis

Ce cours requiert le suivi de la demi-unité « Bioinformatique pour la génomique et la protéomique: méthodes » (SBBAU3L, Semestre 1) ou d’une unité équivalente