Travaux Pratiques de Biochimie Structurale et de Génomique (6 crédits) [Duneau J-P.]

Code: SBBAU9L

Objectif(s): Acquérir une pratique de techniques utilisées dans les domaines de la biochimie structurale et de la génomique en incluant des méthodologies issues de la physicochimie et de la biologie moléculaire. Être capable de mener une réflexion critique sur les résultats obtenus en regard de données bibliographiques.

Volume horaire: 0h de CM - 0h de TD - 90h de TP 

Description

Production de protéines recombinantes: les étudiants seront amenés à produire une ou plusieurs protéines de fusion (GST/GFP-facteur de régulation...). Ils devront réaliser le clonage, la transformation, l'expression et la purification de leurs protéines par chromatographie d'affinité. Etudes spectroscopique et biochimique: Ces protéines seront étudiées par des approches quantitatives, au moyen de la spectroscopie de fluorescence : mesure de fixation, polarisation de fluorescence, FRET, étude de la coopérativité de la fixation. Une journée de RMN et une journée de cristallogenèse sont également proposées. Etude génomique des séquences régulatrices: la fixation de ces protéines sur un oligonucléotide spécifique et muté par PCR sera étudiée par gel retard, la cartographie du site de fixation permettra de réaliser une recherche bioinformatique de la région régulatrice dans une base de données génomiques.

Prérequis

Avoir suivi les unités Structure et fonction des protéines: mécanismes (SBBAU5L, Semestre 1) et Concepts et approches de la génomique (SBBAU1L, Semestre 1).