Caractérisation de souches bactériennes à partir de séquences répétées
Coloration du stage: Bioinformatique/Génomique
Nom et email de l'encadrant: Tempel Sébastien (
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) / Talla Emmanuel (
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)
Résume
Tous les organismes vivants contiennent des répétitions de séquences tels que les éléments transposables ou les microsatellites. Une étude préliminaire a montré que chaque organisme présente un nombre variable (taille, nombre, nature) de répétitions avec des localisations indépendantes les unes des autres même chez les organismes évolutivement très proches. L’objectif du stage est de mettre en evidence les patterns de répétitions uniques associés à chaque organisme, et qui in fine permettra l’identification unique de l’organisme.
Langage de programmation : Python/PERL
