Resumé du projet.

Les éléments transposables sont les éléments biologiques les plus présents dans un génome et le premier facteur d’évolution des génomes. Au sein de l’équipe, nous avons créé VisualTE (outil standalone JAVA) permettant afficher et d’analyser l’ensemble des éléments transposables d’un génome (Tempel et Talla, 2015). Afin de permettre une utilisation de VisualTE via une interface web, nous proposons de créer une application web associé de l’outil VisualTE. La première partie de ce stage consistera à déterminer le langage web graphique le plus adapté à l’affichage Web de l'ensemble des annotations. Puis, dans la seconde partie du stage, l’étudiant(e) mettra en œuvre ce langage pour implémenter les différentes fonctions de VisualTE via l’application web.

Langage de programmation: HTML5, SVG, Canvas, autre langage graphique, ...

CONTACT: Tempel Sebastien - Laboratoire de Chimie Bacterienne, UMR7283.

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