- Unité d’accueil : CIML

- Nom de l’encadrant : Marc BARAD

- Courriel de l’encadrant : Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.

- Bref descriptif (quelques lignes) :
Chaque jour, un contrôle de qualité sous la forme d’un échantillon avec trois niveaux de fluorescence est enregistré sur chaque instrument sous forme de fichier FCS 3.0.
Un logiciel de contrôle de qualité, appelé CST, existe déjà sur chaque instrument mais il ne prend pas en compte certains paramètres et n’est pas disponible quand l’instrument est utilisé.
Pour optimiser le contrôle de qualité, il faudrait centraliser le contrôle de qualité de tous les instruments sur un poste avec un suivi des performances
Cet outil pourrait intéresser toutes les plateformes de cytométrie, en recherches ou cliniques.

- Compétences techniques attendues (langage de programmation, outils imposés, etc.) :
* R et SGBD
* Norme FCS 3.0 : http://murphylab.web.cmu.edu/FCSAPI/FCS3.html
* CST : http://static.bdbiosciences.com/documents/BD_Webinar-CSandT_06_2012.pdf?_ga=2.42225260.854190215.1511268252-759061244.1508931184
* Ressources R : https://www.bioconductor.org/help/search/index.html?q=flow+cytometry/ et https://www.rdocumentation.org/packages/flowCore/versions/1.38.2